PCR产物直接测序的原理
原理:是来至于双脱氧链终止法——现在应用最多的核酸测序技术,由Sanger等1977年提出:模板经过测序PCR反应后形成3'末端带有荧光标记(早期用同位素标记)的相差一个碱基的不同长度的产物,再根据每段DNA产物的电泳速度来检测整段DNA的序列。以上——手打——希望对你有帮助优点:一是操作易于标准化与自动化,因为它是一个单一的酶的反应过程,不依赖于生物体;二是通过一次测序反应就能确定样品中某个等位基因的顺序,而PCR产物克隆后测序时,样品顺序要在测定了数个克隆片段之后才能确定。因为只有这样,才能区别突变是基因组本来就有的,还是由于Tag聚合酶在PCR过程中错误掺入核苷酸引起的。
纯化的pcr产物测序需要什么样的要求
纯化的pcr产物测序需要的要求:
(1)扩增产物必须特异性扩增,条带单一。如果扩增产物中存在非特异性扩增产物,一般难以得到好的测序结果;
(2)必须进行胶回收纯化;
(3)DNA纯度在1.6-2.0之间,浓度50ng/ul以上。
方法
(1) 在PCR反应液中加入3倍体积的Buffer PCR-A,若需加入的Buffer PCR-A不足100μl,则加入100μl。
(2) 将DNA-prep Tube置于2-ml Microfuge Tube中,将步骤⑴中的混合液移入DNA-prep Tube中,5500rpm离心1min。
(3) 弃滤液,将DNA-prep Tube置回到原2-ml Microfuge Tube中,加入500μl Buffer W1,5500rpm离心1min。
(4) 弃滤液,将DNA-prep Tube置回到原2-ml Microfuge Tube 中,加入700μl 已加无水乙醇的Buffer W2,5500rpm离心1min,以同样的方法再用700μl已加无水乙醇的BufferW2洗涤一次。
(5) 弃滤液,将DNA-prep Tube置回到原2-ml Microfuge Tube中,14000rpm离心1min。
(6) 连滤液一并弃掉收集管,将DNA-prep Tube 置于一新的1.5ml 离心管中,在silica 膜中央加入25-30μl Eluent或去离子水(65℃预热)。 (7) 室温静置2min,14000rpm离心1min洗脱DNA。 (8) 取5μl样品,1%琼脂糖凝胶电泳检测纯化结果。